|
|
Maurizio Mencuccini, Jordi Martinez-Vilalta, Josep Piñol, Lasse Loepfe, Mireia Burnat, Xavier Alvarez, et al. (2010). "A quantitative and statistically robust method for the determination of xylem conduit spatial distribution " . American Journal of Botany, 97(8), 1247–1259.
Abstract: Premise of the study: Because of their limited length, xylem conduits need to connect to each other to maintain water transport from roots to leaves. Conduit spatial distribution in a cross section plays an important role in aiding this connectivity. While indices of conduit spatial distribution already exist, they are not well defined statistically. * Methods: We used point pattern analysis to derive new spatial indices. One hundred and five cross-sectional images from different species were transformed into binary images. The resulting point patterns, based on the locations of the conduit centers-of-area, were analyzed to determine whether they departed from randomness. Conduit distribution was then modeled using a spatially explicit stochastic model. * Key results: The presence of conduit randomness, uniformity, or aggregation depended on the spatial scale of the analysis. The large majority of the images showed patterns significantly different from randomness at least at one spatial scale. A strong phylogenetic signal was detected in the spatial variables. * Conclusions: Conduit spatial arrangement has been largely conserved during evolution, especially at small spatial scales. Species in which conduits were aggregated in clusters had a lower conduit density compared to those with uniform distribution. Statistically sound spatial indices must be employed as an aid in the characterization of distributional patterns across species and in models of xylem water transport. Point pattern analysis is a very useful tool in identifying spatial patterns.
Keywords: Geyer; hydraulic conductivity; point pattern analysis; Ripley; Spatstat; vessel clusters; xylem anatomy; xylem network
|
|
|
|
Ferran Poveda, Jaume Garcia, Enric Marti, & Debora Gil. (2010). "Validation of the myocardial architecture in DT-MRI tractography " In Medical Image Computing in Catalunya: Graduate Student Workshop (pp. 29–30). Girona (Spain).
Abstract: Deep understanding of myocardial structure may help to link form and funcion of the heart unraveling crucial knowledge for medical and surgical clinical procedures and studies. In this work we introduce two visualization techniques based on DT-MRI streamlining able to decipher interesting properties of the architectural organization of the heart.
|
|
|
|
Sandra Pujades, Francesc Carreras, Manuel Ballester, Jaume Garcia, & Debora Gil. (2008). "A Normalized Parametric Domain for the Analysis of the Left Ventricular Function " In Proceedings of the Third International Conference on Computer Vision Theory and Applications (VISAPP’08) (Vol. 1, pp. 267–274).
Abstract: Impairment of left ventricular (LV) contractility due to cardiovascular diseases is reflected in LV motion patterns. The mechanics of any muscle strongly depends on the spatial orientation of its muscular fibers since the motion that the muscle undergoes mainly takes place along the fiber. The helical ventricular myocardial band (HVMB) concept describes the myocardial muscle as a unique muscular band that twists in space in a non homogeneous fashion. The 3D anisotropy of the ventricular band fibers suggests a regional analysis of the heart motion. Computation of normality models of such motion can help in the detection and localization of any cardiac disorder. In this paper we introduce, for the first time, a normalized parametric domain that allows comparison of the left ventricle motion across patients. We address, both, extraction of the LV motion from Tagged Magnetic Resonance images, as well as, defining a mapping of the LV to a common normalized domain. Extraction of normality motion patterns from 17 healthy volunteers shows the clinical potential of our LV parametrization.
Keywords: Helical Ventricular Myocardial Band; Myocardial Fiber; Tagged Magnetic Resonance; HARP; Optical Flow Variational Framework; Gabor Filters; B-Splines.
|
|
|
|
Oriol Pujol, Debora Gil, & Petia Radeva. (2005). "Fundamentals of Stop and Go active models " . Image and Vision Computing, 23(8), 681–691.
Abstract: An efficient snake formulation should conform to the idea of picking the smoothest curve among all the shapes approximating an object of interest. In current geodesic snakes, the regularizing curvature also affects the convergence stage, hindering the latter at concave regions. In the present work, we make use of characteristic functions to define a novel geodesic formulation that decouples regularity and convergence. This term decoupling endows the snake with higher adaptability to non-convex shapes. Convergence is ensured by splitting the definition of the external force into an attractive vector field and a repulsive one. In our paper, we propose to use likelihood maps as approximation of characteristic functions of object appearance. The better efficiency and accuracy of our decoupled scheme are illustrated in the particular case of feature space-based segmentation.
Keywords: Deformable models; Geodesic snakes; Region-based segmentation
|
|
|
|
Oriol Rodriguez-Leon.A.Carol, H.Tizon, Eduard Fernandez-Nofrerias, Josefina Mauri, Vicente del Valle, Debora Gil, et al. (2005)." Model estadístic-determinístic per la segmentació de l adventicia en imatges d ecografía intracoronaria" . Rev Societat Catalana Cardiologia, 5, 41.
|
|
|
|
Oriol Rodriguez-Leon, Josefina Mauri, Eduard Fernandez-Nofrerias, M.Gomez, Antonio Tovar, L.Cano, et al. (2002)." Ecografia Intracoronària: Segmentació Automàtica de area de la llum" In XXXVIII Congreso Nacional de la Sociedad Española de Cardiología..
|
|
|
|
Oriol Rodriguez-Leon, Debora Gil, Eduard Fernandez-Nofrerias, H.Tizon, S.Montserrat, Vicente del Valle, et al. (2007)." Caracterització de la Perfusió Miocàrdica mitjançant anàlisi estadístic de l espectre en l angiografia de contrast" In XIX Congrés de la Societat Catalana de Cardiologia de Barcelona (130). Barcelona (Spain).
Abstract: La valoració de la integritat de la microcirculació coronària aporta informació pronòstica en pacients amb infart agut de miocardi en els que es realitza angioplastia primària. Aquesta valoració és subjectiva i presenta una important variabilitat si no es duta a terme per personal experimentat. Presentem una eina d’anàlisi d’imatge que permet fer una valoració de la microcirculació coronària a partir de seqüències d’angiografia. Hem analitzat les variacions locals en el nivell de gris de la imatge durant la seqüència angiogràfica. Hem identificat els principals fenòmens observats (respiració, batec cardíac, tinció arterial, tinció miocàrdica i soroll radiològic) mitjançant un anàlisi estadístic de l’espectre de Fourier de l’evolució al llarg del temps de la mitja local. Aquest mateix anàlisis permet determinat la influència de cadascun d’ells en la extracció del patró de tinció i selecciona la respiració com el fenomen que més distorsiona el patró de tinció original. Els descriptors proposats s’obtenen fora del rang espectral respiratori. Hem testat la seva capacitat per a detectar els tres fenòmens principals (tinció miocàrdica (MS), tinció arterial (AS) i soroll (NS)) independentment de la respiració. La capacitat de discriminació dels descriptors ha estat valorada mitjançant un mètode de crossvalidation en 30 seqüències d’angiografia. Els descriptors emprats permeten caracteritzar la tinció miocàrdica amb una alta eficiència i fiabilitat. A més no hi ha diferències significatives en l’anàlisi de les seqüències obtingudes amb el pacient respirant amb normalitat o en apnea
|
|
|
|
Oriol Rodriguez-Leon, Debora Gil, & Eduard Fernandez-Nofrerias. (2006)." Analisis en los cambios en el nivel de gris en las secuencias angiograficas mediante descriptores estadisticos para determinar la perfusion miocardica" . Revista Española de Cardiología, 59 Supl 2-166(2), 128.
|
|
|
|
Oriol Rodriguez-Leon, Josefina Mauri, Eduard Fernandez-Nofrerias, C.Garcia, R.Villuendas, Vicente del Valle, et al. (2003)." Reconstruction of a spatio-temporal model of the intima layer from intravascular ultrasound sequences" . European Heart Journal, .
|
|
|
|
Oriol Rodriguez-Leon, Josefina Mauri, Eduard Fernandez-Nofrerias, Antonio Tovar, Vicente del Valle, Aura Hernandez-Sabate, et al. (2004)." Utilización de la Estructura de los Campos Vectoriales para la Detección de la Adventicia en Imágenes de Ecografía Intracoronaria" . Revista Internacional de Enfermedades Cardiovasculares Revista Española de Cardiología, 57(2), 100.
|
|
